Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A5Q9BY07 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms