Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.9 ms