Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms