Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHP1Q99653 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms