Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP19Q99542 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms