Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC38A2Q96QD8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC38A2Q96QD8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms