Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALS2CR12Q96Q35 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms