Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMG1Q96Q15 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMG1Q96Q15 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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