Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMTK3Q96Q04 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMTK3Q96Q04 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms