Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms