Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM17Q96I25 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms