Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX27Q96GQ7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms