Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRRFQ96E11 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRRFQ96E11 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms