Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGBD4Q96DM1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms