Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms