Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRF1Q92994 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms