Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA1

POMGNT1, Protein O-linked-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT1Q8WZA1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POMGNT1Q8WZA1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POMGNT1Q8WZA1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms