Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMER3Q8N944 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMER3Q8N944 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms