Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC155Q8N6L0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms