Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME8Q8N427 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms