Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB4Q86W47 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms