Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYFIP1Q7L576 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYFIP1Q7L576 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms