Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP53Q70EK8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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