Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPGS1Q6ZTW0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPGS1Q6ZTW0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPGS1Q6ZTW0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPGS1Q6ZTW0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPGS1Q6ZTW0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPGS1Q6ZTW0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPGS1Q6ZTW0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPGS1Q6ZTW0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPGS1Q6ZTW0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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