Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAPN12Q6ZSI9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms