Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms