Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3L3Q68CJ9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms