Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF123Q5XPI4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF123Q5XPI4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms