Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM208BQ5VWN6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM208BQ5VWN6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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