Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRNL1Q5VV63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRNL1Q5VV63 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRNL1Q5VV63 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRNL1Q5VV63 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms