Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms