Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM74A1Q5RGS3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM74A1Q5RGS3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms