Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms