Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HS1BP3Q53T59 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HS1BP3Q53T59 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms