Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ANKRD39Q53RE8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ANKRD39Q53RE8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms