Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP28Q4G0W2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms