Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7Z2

YNL042W-B, Uncharacterized protein YNL042W-B, yeast

Predictions only

Length 85 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL042W-B	Q3E7Z2	tF(GAA)G	tF(GAA)G	73 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	tF(GAA)H1	tF(GAA)H1	73 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	tF(GAA)H2	tF(GAA)H2	73 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	tF(GAA)M	tF(GAA)M	73 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	tF(GAA)P1	tF(GAA)P1	73 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	tF(GAA)P2	tF(GAA)P2	73 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	TAD1	YGL243W	1203 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	STF2	YGR008C	255 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	PAU12	YGR294W	363 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	SMD3	YLR147C	306 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR200W-A	YBR200W-A	165 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	GEA2	YEL022W	4380 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	AI1	Q0050	2505 nt		0.09	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	TRS65	YGR166W	1683 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	BEM3	YPL115C	3387 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	PAU2	YEL049W	363 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	KEG1	YFR042W	603 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	ALG13	YGL047W	609 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YHR063W-A	YHR063W-A	336 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YJL032W	YJL032W	315 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	FAR3	YMR052W	615 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	MUM2	YBR057C	1101 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR224W	YBR224W	516 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	GPX2	YBR244W	489 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	PPN1	YDR452W	2025 nt		0.08	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNL054W-B	YNL054W-B	5250 nt		0.07	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	LSM6	YDR378C	261 nt		0.07	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR045C	YGR045C	363 nt		0.07	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR199W	YOR199W	330 nt		0.07	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPR170C	YPR170C	336 nt		0.07	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	MPT5	YGL178W	2580 nt		0.07	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR265W	YGR265W	411 nt		0.06	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	GOS1	YHL031C	672 nt		0.06	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YKL183C-A	YKL183C-A	213 nt		0.06	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	NUT2	YPR168W	474 nt		0.06	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	NUT1	YGL151W	3399 nt		0.05	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR262W	YDR262W	819 nt		0.05	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	DUO1	YGL061C	744 nt		0.05	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YLR031W	YLR031W	561 nt		0.05	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	HUG1	YML058W-A	207 nt		0.05	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		0.05	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL150C	YOL150C	312 nt		0.05	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YCK3	YER123W	1575 nt		0.05	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR63	snR63	255 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	SLX9	YGR081C	633 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR290W	YGR290W	444 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	SPO13	YHR014W	876 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	LCL2	YLR104W	396 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	VPS28	YPL065W	729 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	RTC6	YPL183W-A	282 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBP2	YGL060W	1926 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	BIR1	YJR089W	2865 nt		0.04	□□□□□ -2.4
YNL042W-B	Q3E7Z2	AFR1	YDR085C	1863 nt		0.03	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	DBP6	YNR038W	1890 nt		0.03	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	VPS74	YDR372C	1038 nt		0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	IST3	YIR005W	447 nt		0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	RPL37A	YLR185W	267 nt		0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR105W	YOR105W	327 nt		0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	ERV15	YBR210W	429 nt		0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	STO1	YMR125W	2586 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	PEP3	YLR148W	2757 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	IQG1	YPL242C	4488 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	BRO1	YPL084W	2535 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR509W	YDR509W	348 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	IMP3	YHR148W	552 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YLR042C	YLR042C	486 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	PAI3	YMR174C	207 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL013W-A	YOL013W-A	192 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL014W	YOL014W	375 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	SLI15	YBR156C	2097 nt		0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	PXA2	YKL188C	2562 nt		0	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	OCA6	YDR067C	675 nt		0	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	SLD5	YDR489W	885 nt		0	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	NBP1	YLR457C	960 nt		0	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YCL046W	YCL046W	324 nt		0	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDL009C	YDL009C	324 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YEL030C-A	YEL030C-A	315 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	SBH1	YER087C-B	249 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	RSM27	YGR215W	333 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YMR324C	YMR324C	243 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBL073W	YBL073W	312 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL050C	YOL050C	321 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR062C	YBR062C	543 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	AIM44	YPL158C	2277 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	NOC3	YLR002C	1992 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	STE5	YDR103W	2754 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	SAG1	YJR004C	1953 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR003W-A	YDR003W-A	123 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YIL134C-A	YIL134C-A	204 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	COX8	YLR395C	237 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	MKT1	YNL085W	2493 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YFL002W-B	YFL002W-B	1317 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR161W-A	YGR161W-A	1317 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBL100W-A	YBL100W-A	1317 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		-0.03	□□□□□ -2.41

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.8 ms