Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR1Q2NL82 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms