Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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