Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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