Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NTRK3Q16288 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK3Q16288 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms