Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85BQ15834 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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