Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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