Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCOLCEQ15113 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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