Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms