Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD4Q14839 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD4Q14839 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
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