Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA3AQ14563 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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