Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPIDRQ14159 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPIDRQ14159 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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