Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB33AQ14088 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB33AQ14088 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB33AQ14088 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB33AQ14088 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB33AQ14088 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB33AQ14088 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB33AQ14088 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB33AQ14088 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB33AQ14088 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB33AQ14088 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB33AQ14088 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB33AQ14088 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB33AQ14088 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB33AQ14088 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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