Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
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